Studia II-go stopnia umożliwiają zdobycie tytułu magistra i przygotowanie się do podjęcia pracy zawodowej. Przeznaczone są dla osób, które posiadają dyplom inżyniera i gwarantują uzyskanie specjalistycznej wiedzy w dziedzinie Energetyki, Energetyki odnawialnej i zarządzania energią lub Technologii chemicznej. Obecnie studenci mogą wybrać jedną z 15 specjalności, których opis przedstawiony został poniżej.

Ciepłownictwo, Ogrzewnictwo i Klimatyzacja
Studia na tej specjalności umożliwiają przygotowanie specjalistów w zakresie efektywnego wykorzystania energii, projektowania, budowy i eksploatacji urządzeń cieplnych, procesów spalania i ochrony środowiska, ciepłownictwa i ogrzewnictwa, wentylacji i klimatyzacji, zintegrowanych systemów zarządzania energią.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Energetyka Jądrowa
Studia na specjalności Energetyka jądrowa obejmują zagadnienia: nadprzewodnictwa, półprzewodników, materiałów magnetycznych, termoelektrycznych, dielektryków, kompozytów, a także stosowanie wodoru jako nośnika energii rokującego zajęcie istotnego miejsca w energetyce przyszłości. Szczególna uwaga poświęcana jest energetyce jądrowej, głównie w jej zaawansowanych postaciach.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Modelowanie Komputerowe w Energetyce
Specjalność umożliwia kształcenie w zakresie wykorzystywania metod komputerowych do modelowania procesów fizycznych i chemicznych występujących w energetyce. Uzyskają wiedzę w zakresie modelowania elektrowni oraz identyfikowania problemów w systemach energetycznych. Uzyskają także wiedzę i umiejętności do tworzenia własnych programów i procedur numerycznych oraz wiedzę niezbędną do projektowania procesów energetycznych, sterowania tymi procesami i ich optymalizacji.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Systemy, Maszyny i Urządzenia Energetyczne
Problematyka studiów obejmuje projektowanie, budowę i eksploatację kotłów, turbin parowych, turbin gazowych, układów parowo-gazowych, silników spalinowych, wymienników, sieci cieplnych, węzłów cieplnych, pomp, sprężarek, wentylatorów, układów pomiarowych cieplno-przepływowych i komputerowych układów sterujących.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Urządzenia, sieci i systemy elektroenergetyczne
Studia umożliwiają uzyskanie wszechstronnej wiedzy w zakresie wytwarzania, przesyłu, rozdziału i efektywnego użytkowania energii elektrycznej, w tym o technicznych aspektach przekształcania różnych form energii, w szczególności energii mechanicznej na elektryczną oraz elektrycznej na mechaniczną i cieplną.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Systemy magazynowania i konwersji energii dla e-mobiliti,
Podstawowym aspektem kształcenia będzie zdobycie przez studentów wiedzy w zakresie właściwości materiałów (w tym nanomateriałów), ich stosowania, badania oraz projektowania właściwości funkcjonalnych dla potrzeb systemów magazynowania i konwersji energii dla e-mobility. Zdobyta wiedza pozwoli absolwentom znaleźć pracę w sektorze samochodowym, tradycyjnym sektorze energetycznym, jak również w zakresie nowoczesnych technologii energetycznych, gdzie sprawy materiałowe mają decydujące znaczenie.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Technologie energetyki odnawialnej
Studnia na tej specjalności umożliwiają kształcenie w zakresie energii odnawialnych i racjonalnego wykorzystania energii. Główny nacisk kładziony jest na współpracę z przemysłem oraz prowadzenie badań z zakresu energetyki odnawialnej. Absolwent będzie posiadać zaawansowaną wiedzę w zakresie instalacji: grzewczych oraz chłodniczych, biomasowych, opartych na energii słonecznej, sterowania w energetyce oraz inteligentnymi budynkami, energetyki wodnej, systemów hybrydowych, oraz społecznych aspektów energetyki odnawialnej.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Ekonomika, polityka i zarządzanie energią
Studia na tej specjalności umożliwiają kształcenie w zakresie problemów rozwoju energetyki w aspekcie ekonomicznym, społecznym, zarządzania i ochrony środowiska. Absolwent przygotowany jest do zajmowania się zagadnieniami ekonomiki, polityki energetycznej oraz zarządzania energią w sektorze paliwowo-energetycznym. Ponadto absolwent posiądzie wiedzę z zakresu odnawialnych źródeł energii, wytwarzania i dystrybucji paliw, modelowania matematycznego sektorów paliwowo-energetycznych, rynków energii oraz prawa energetycznego i gazowego.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Analityka przemysłowa i środowiskowa
Absolwenci studiów II stopnia specjalności Analityka przemysłowa i środowiskowa uzyskują szczegółowe wiadomości z zakresu metod analitycznych stosowanych w badaniach środowiska naturalnego, pomiarów emisji szkodliwych czynników chemicznych i radiochemicznych, oraz kontroli jakości produktów. Mają wiedzę z zakresu podstaw fizycznych i fizykochemicznych na których opierają się różne nowoczesne i najczęściej stosowane metody analizy chemicznej. Uzyskuję także poszerzoną wiedzę z zakresu statystycznego opracowania wyników analiz niezbędną we wdrażaniu procedur analitycznych w laboratoriach pracujących zgodnie z wymogami systemów jakości. Absolwenci tej specjalności są przygotowani do pracy w przemysłowych laboratoriach analitycznych przemysłowych, do monitoringu środowiska zarówno z punktu widzenia ekotoksyn pochodzenia przemysłowego jak i radionuklidów alfa i gamma promieniotwórczych, pracy w jednostkach badawczych i naukowych zajmujących się badaniami środowiskowymi i służbach kontroli jakości lub ochrony środowiska naturalnego.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Gospodarka Paliwami i Energią
Absolwenci tej specjalności są przygotowani do zajmowania się zagadnieniami związanymi z ekonomiką i organizacją sektora paliwowo-energetycznego, racjonalną gospodarką paliwami i energią, matematycznym modelowaniem systemów elektroenergetycznych, zarządzaniem energią,  niekonwencjonalnymi źródłami energii, polityką energetyczną, problematyką zrównoważonego rozwoju energetyki i jego związku z ochroną środowiska naturalnego.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Technologia Paliw
Absolwenci tej specjalności uzyskują wiedzę z zakresu technologii paliw stałych, ciekłych i gazowych. Przygotowani są do zajmowania się zagadnieniami związanymi z procesami spalania i odgazowania węgla, wzbogacania i uszlachetnia paliw ciekłych i bezdymnych paliw stałych, gazownictwa we wszystkich sferach jego funkcjonowania (prac projektowych, konstruktorskich budowlano-montażowych, eksploatacji infrastruktury gazowniczej, instalacji gazowych i działalności analityczno-laboratoryjnej), technologią wyrobów węglowych i grafitowych oraz wysoce specjalistycznych materiałów technologicznych z wykorzystaniem nowych prekursorów chemicznych.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Proekologiczne procesy inżynierii i technologii chemicznej,
Opis wkrótce.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Technologie Chemiczne w energetyce
Opis wkrótce.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Clean Fossil and Alternative Fuels Energy
Complete a MSc programme in Clean Fossil and Alternative Fuels Energy provided by the Faculty of Energy and Fuels AGH University of Science and Technology. The program focuses on the key aspects of energy production and the application of alternative and fossil fuels, among the shale gas, biomass, and coal. Albeit a fossil fuel, coal is believed to offer a good medium term solution to energy production, as it is an abundant source available at a relatively stable price and provided by many international suppliers, offering the guarantee of energy security.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów

Clean Fossil and Alternative Fuels Energy - KIC
Complete a MSc programme in Clean Fossil and Alternative Fuels Energy provided by the Faculty of Energy and Fuels AGH University of Science and Technology. The program focuses on the key aspects of energy production and the application of alternative and fossil fuels, among the shale gas, biomass, and coal. Albeit a fossil fuel, coal is believed to offer a good medium term solution to energy production, as it is an abundant source available at a relatively stable price and provided by many international suppliers, offering the guarantee of energy security.
- dodatkowe informacje: plan studiów i karty przedmiotów